тогда рискну предположить, что проблема ваша либо в иксах либо в драйвере (где то что то "обновилось").
подобный курсор в дебиане (если вы про часы "типа наручных") до загрузки рабочего стола gnome появляется. пардон, тут либо усиленно гуглить по буржуйским форумам, либо найдется гуру, который изначально знает, как порешать. вы бы скриншот курсора показали (который с часами). все таки, сдается мне, не в теме курсора дело.)
upd: могу еще посоветовать
вот с этим решением ознакомиться.