Владимир, спасибо! У меня такая же ситуация, но на панели "Cairo-Dock" значки программ: Master PDF Editor 5 и Double Commander так же двоились. По этой причине иногда по ошибке запускал второй экземпляр программы. Единственно нужно не забыть после закрытия программы удалить ярлык с панели, иначе будет опять двоить.
Валерий Рочев